火影50年末，第三次忍界大战结束。在漫长战线上付出惨痛代价的木叶村最终取得了胜利，众多为取得战争胜利而牺牲的英雄们，名字被刻在了慰灵碑上。面对战争给木叶村带来的沉重损失，三代目猿飞日斩主动承担责任，请辞火影一职。在战争中立下显赫战功的波风水门接任第四代火影。（很合理的怀疑这比是丢下烂摊子跑路了，战争结束之后百废待兴，才是更加需要一个经验丰富的人搞经济好吧。
当然，后面三代也为水门提供了帮助就是了。）
暗流涌动：
伴随着战争停歇，木叶村迎来了一波婴儿潮，火影忍者主角团悉数登场，新生一代开始进入历史的舞台。
饱经战火的木叶村原以为会拨云见日，枯木逢春，迎来又一轮和平盛世，但等待着他们的却是暗流涌动的内乱年代。
火影50年-51年
50年2月15日，多有也出生
50年3月9日，天天出生（小富婆）
50年6月20日，左近右近出生
50年6月26日，次郎坊出生
50年7月3日，日向宁次出生
50年9月6日，黑土出生
50年11月25日，佐井出生
50年11月27日，李洛克出生
50年12月16日，鬼同丸出生
火影51年，卡卡西加入暗部。
51年1月19日，我爱罗出生
51年1月23日，油女志乃出生
51年2月14日，卡鲁伊出生
51年2月18日，鬼灯水月出生
51年3月28日，春野樱出生
51年5月1日，秋道丁次出生
51年6月18日，志保出生
51年6月20日，香磷出生
51年7月17日，犬冢牙出生
51年7月23日，宇智波佐助出生（二柱子）
51年9月22日，奈良鹿丸出生
51年9月23日，山中井野出生
51年10月10日，漩涡鸣人出生
51年12月26日，奥摩伊出生
51年12月27日，日向雏田出生
火影51年10月10日：
神秘面具人深夜袭击木叶，九尾暴走。由于事发突然，虽然木叶忍者奋力阻止，九尾依然造成巨大破坏，大批忍者伤亡，四代目火影波风水门和妻子漩涡玖辛奈亦在此次事件中牺牲，史称“九尾之乱”。
动乱后木叶村人心涣散，各派势力貌合神离，三代目猿飞日斩重新接任火影。（这也是一个烂摊子。）
火影52年
三代火影猿飞日斩亲自带队侦破反人类试验隐藏据点，大蛇丸人体实验败露，叛逃木叶，建立新据点，加入晓组织。
火影53年
一年级的宇智波鼬提前从忍者学校毕业，成为下忍，时年7岁。
火影54年
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