阴阳属性的结合也可以产生更强大的力量，为忍者的战斗提供更多的可能性。
阴属性查克拉可以强化想象，为一事物塑造形体。在战斗中，阴属性查克拉常用于施展幻术，操纵敌人的感知，使其陷入幻觉。此外，阴属性查克拉还可以操纵阴影、灵魂，勾勒事物的身体形象。操纵影子的秘术、影响五感的秘术、灵魂出窍的秘术，赋予画像短暂生命的秘术，许多术甚至危险的可以叫做禁术。
阳属性查克拉则主要强化身体强度、身体机能、肉身的改造。阳属性查克拉可以使忍者的身体变得更加强壮，提升力量、速度和耐力。在战斗中，阳属性查克拉还可以用于身体变形，为死物赋予生机。拆开关节拉伸身体吸收查克拉的秘术、肢体化为蛇的秘术、肉体变形为纸张秘术，阴阳属性在忍者世界中的应用非常广泛。
也许曾经不同的忍族祖先会根据自己的特点和需求，选择更适合当时自己查克拉的修炼方式，在死亡了不知道几繁的生命后，诞生了使用秘术的忍族。与本就有大筒木血脉的忍族不一样，这些人已经不知不觉被其同化，走向了大筒木的查克拉科技。
而由于火遁、水遁、风遁、雷遁、土遁的查克拉模式，有可能并不真的是火焰、流水、气流、雷电与土壤，所以本身还有它自己的属性在。
比如并不常见的火属性特性，除了具有火一样高温外，可以附着在其他物体表面，充当可燃物使其燃烧，还可以直接产生能量喷发，对敌人造成爆炸性的伤害；
水属性的镜像、粘性、油性液体性质的变化，可以制造出水流、水球各种流体形态，还可以产生粘性和油性液体性质的变化，使敌人陷入困境；
风属性的切割、聚集、真空，可以形成风刃、风卷等攻击，还可以产生真空，切断敌人的查克拉流动；
雷属性的高温、光幻、身体强化，可以产生雷电、闪电那有的等离子体，还可以强化忍者的身体，以提高神经反应速度和肌肉力量；
土属性的坚硬、物体强化、色彩变化，可以变形成土墙、土柱等物质用于防御，还可以改变物体的色彩，进行迷彩伪装。
不同属性的查克拉可以相互结合，产生更加强大的攻击和防御效果。忍者们会根据自己的特点，在战斗中灵活运用各种属性的查克拉，以取得战斗的胜利。
秦幸博意识到，查克拉的属性其实是对真实物质能量的一种模拟。五种常见的查克拉属性——风、火、水、土、雷，以及两种不常见的属性——阴、阳，都是对真实物质能量的一种对标。
秦幸博猜测，这些属性可能与最接近容易模仿的真实物质能量中的性质有关。例如，火属性模拟火焰或热能的能量形式，水属性模拟流体或液体的能量形式，风属性模拟气流或气体的能量形式，土属性模仿土壤或固体的能量，雷属性可能对应于电能或电磁的能量形式。阴属性可能对应与阳属性可能对应的，都只是形式而非结构，是拟态的模拟形态而非改变为接近的真实结构。
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